Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE3

LCE3D, Late cornified envelope protein 3D, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE3DQ9BYE3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms