Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SALL3Q9BXA9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL3Q9BXA9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms