Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA7

TSSK1B, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK1BQ9BXA7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK1BQ9BXA7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK1BQ9BXA7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms