Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM2Q9BVW6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms