Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAGR1Q9BTK6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PAGR1Q9BTK6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms