Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UPK3BQ9BT76 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPK3BQ9BT76 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms