Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SDF4Q9BRK5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms