Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOXF2Q9BQY4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2Q9BQY4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms