Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSTN3Q9BQT9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN3Q9BQT9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSTN3Q9BQT9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN3Q9BQT9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN3Q9BQT9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN3Q9BQT9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms