Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM7Q9BQ49 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM7Q9BQ49 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms