Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARID3AQ99856 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms