Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
VAT1Q99536 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms