Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SIN3AQ96ST3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms