Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC36.83■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
IFT140Q96RY7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
IFT140Q96RY7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms