Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PHF12Q96QT6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PHF12Q96QT6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms