Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNGAP1Q96PV0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms