Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBP5Q96PP8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP5Q96PP8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP5Q96PP8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP5Q96PP8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBP5Q96PP8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP5Q96PP8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP5Q96PP8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP5Q96PP8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP5Q96PP8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP5Q96PP8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP5Q96PP8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP5Q96PP8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP5Q96PP8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP5Q96PP8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP5Q96PP8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP5Q96PP8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBP5Q96PP8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms