Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC114Q96M63 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC114Q96M63 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms