Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALPK3Q96L96 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms