Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPGRIP1Q96KN7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPGRIP1Q96KN7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms