Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CABS1Q96KC9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms