Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP3Q96JB5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK5RAP3Q96JB5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms