Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRELD1Q96HD1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRELD1Q96HD1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms