Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTSSAQ969W0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms