Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRF1Q92994 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRF1Q92994 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms