Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4DQ92854 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4DQ92854 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms