Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDAQ92838 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDAQ92838 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDAQ92838 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDAQ92838 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDAQ92838 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDAQ92838 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDAQ92838 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDAQ92838 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDAQ92838 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDAQ92838 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EDAQ92838 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EDAQ92838 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDAQ92838 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDAQ92838 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDAQ92838 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDAQ92838 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDAQ92838 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDAQ92838 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDAQ92838 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EDAQ92838 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDAQ92838 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDAQ92838 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EDAQ92838 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDAQ92838 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EDAQ92838 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDAQ92838 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDAQ92838 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDAQ92838 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDAQ92838 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDAQ92838 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDAQ92838 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDAQ92838 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDAQ92838 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDAQ92838 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDAQ92838 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDAQ92838 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDAQ92838 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDAQ92838 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDAQ92838 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDAQ92838 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EDAQ92838 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDAQ92838 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDAQ92838 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDAQ92838 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDAQ92838 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDAQ92838 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDAQ92838 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDAQ92838 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDAQ92838 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDAQ92838 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDAQ92838 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDAQ92838 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDAQ92838 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EDAQ92838 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDAQ92838 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDAQ92838 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDAQ92838 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDAQ92838 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDAQ92838 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDAQ92838 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDAQ92838 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDAQ92838 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDAQ92838 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDAQ92838 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDAQ92838 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDAQ92838 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDAQ92838 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDAQ92838 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDAQ92838 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDAQ92838 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDAQ92838 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EDAQ92838 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDAQ92838 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDAQ92838 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDAQ92838 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDAQ92838 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDAQ92838 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDAQ92838 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDAQ92838 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDAQ92838 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDAQ92838 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDAQ92838 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDAQ92838 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDAQ92838 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EDAQ92838 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDAQ92838 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDAQ92838 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDAQ92838 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDAQ92838 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EDAQ92838 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDAQ92838 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDAQ92838 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EDAQ92838 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDAQ92838 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EDAQ92838 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDAQ92838 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDAQ92838 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDAQ92838 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDAQ92838 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms