Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN4Q92575 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms