Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRSK1Q8TDC3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms