Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9N7

LRRC57, Leucine-rich repeat-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC57Q8N9N7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRRC57Q8N9N7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC57Q8N9N7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms