Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C9orf62Q8N4C0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf62Q8N4C0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms