Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD3Q8N144 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD3Q8N144 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms