Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT20Q8IY31 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT20Q8IY31 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms