Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAD3Q86YD5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LDLRAD3Q86YD5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms