Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSIG1Q86XK7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms