Protein–RNA interactions for Protein: Q86X52

CHSY1, Chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1Q86X52 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHSY1Q86X52 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHSY1Q86X52 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.4 ms