Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC84Q86UT8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC84Q86UT8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms