Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00523Q86TU6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00523Q86TU6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms