Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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