Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z407

CSMD3, CUB and sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSMD3Q7Z407 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSMD3Q7Z407 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSMD3Q7Z407 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSMD3Q7Z407 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSMD3Q7Z407 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSMD3Q7Z407 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSMD3Q7Z407 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSMD3Q7Z407 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSMD3Q7Z407 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSMD3Q7Z407 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSMD3Q7Z407 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSMD3Q7Z407 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSMD3Q7Z407 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSMD3Q7Z407 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSMD3Q7Z407 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSMD3Q7Z407 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSMD3Q7Z407 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSMD3Q7Z407 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSMD3Q7Z407 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms