Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMC6Q7Z403 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC6Q7Z403 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC6Q7Z403 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms