Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP43Q70EL4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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USP43Q70EL4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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USP43Q70EL4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP43Q70EL4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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