Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP34Q70CQ2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP34Q70CQ2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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