Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYDE1Q6ZW31 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155 ms