Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF7Q6Q0C0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms