Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO38Q6PIJ6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO38Q6PIJ6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms