Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RFWD3Q6PCD5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms