Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC42EP5Q6NZY7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC42EP5Q6NZY7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms