Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAVIN1Q6NZI2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.4 ms