Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3F3CQ6NXT2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
H3F3CQ6NXT2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms